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文献导读:尊龙凯时助力PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

来源:邢志彩 日期:2025-03-21

2019年11月,加利福尼亚大学旧金山分校的研究团队在《Nature Medicine》杂志上发表了一项关于肠道病毒感染与儿童急性无力脊髓炎(AFM)关系的研究。该研究采用了PhIP-seq技术以及病毒组抗原库,对42名确诊AFM的儿童和58名其他神经系统疾病儿童的脑脊液样本进行检测,以筛选与AFM病因学相关的病毒特异性抗体。

文献导读:尊龙凯时助力PhIP-seq技术在复杂感染性疾病病因学研究中的应用

研究结果显示,AFM患者组中的肠道病毒抗体显著富集,且通过ELISA方法验证了这一发现。研究表明,肠道病毒感染可能是造成大多数AFM病例的关键因素。这一发现为未来肠道病毒相关AFM的临床诊断提供了一条重要的路径。

研究背景

急性无力脊髓炎于2012年在美国首次被发现,随后累积了超过500名儿童患者。在每两年的爆发期中,常伴随肠道病毒EV-D68型和EV-A71型的暴发。然而,AFM的病因一直难以确认,因为在少于50%的病例中通过检测发现了肠道病毒,且只有约2%的AFM患者脑脊液样本中能够检测到肠道病毒的核酸。这使得研究人员担心AFM可能由未被识别的病原体或免疫反应引起。

为了明确AFM的发病原因,研究人员运用了PhIP-seq技术,分析AFM患儿及对照组的脑脊液中病毒抗体谱。这一高通量技术能够一次性检测数百种病毒的特异性抗体,最终通过ELISA实验进行结果验证。

主要研究结果

结果一

PhIP-seq技术全局性地分析了AFM组儿童特有的病毒抗体反应,发现小RNA病毒(Picornaviridae)科中的肠病毒(Enterovirus)属抗体在AFM组中的表现显著高于对照组。

结果二

数据分析进一步揭示,产生免疫原性的抗原肽段来源于整个肠道病毒基因组的蛋白质。序列分析显示,PhIP-seq技术不仅能够识别已报道的线性表位序列,还能发现新的线性结合表位。

结果三

通过对EV病毒VP1蛋白的ELISA验证,结果显示AFM儿童组大多数脑脊液样本中(22/26)能够检测到EV信号,相较于对照组(7/50),这一结果与PhIP-seq的检测结果高度一致。

研究结论与PhIP-seq技术

噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-seq)是一种高通量抗体谱检测技术,结合了高容量的噬菌体展示多肽库、抗体免疫沉淀以及高通量测序。此技术可针对数十万种抗原进行血清抗体检测,为免疫力相关研究提供强有力的工具。

在PhIP-seq技术中,目标抗原会被分解成具有重叠区的肽段,随后合成相应的DNA寡核苷酸并连接到载体上形成多肽抗原库。在样本血清与多肽抗原库孵育后,通过磁珠富集特异性抗体的噬菌体,随后进行PCR扩增、建库及测序,最终获得抗原多肽序列。

关于公司

上海抗码芯瑞生物科技有限公司(简称“抗码芯瑞”)由上海交通大学知名教授领衔创立,专注于蛋白组学和抗体组学研究超过20年。公司致力于前沿技术方法的持续开发与成果转化,建立了噬菌体免疫沉淀测序(PhIP-seq)技术平台,并提供定制化抗原库服务。

抗码芯瑞基于PhIP-seq平台开展高通量筛选、数据分析及验证技术服务,为抗体组学研究提供整体解决方案。欲了解更多信息,请联系尊龙凯时

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